64 Угольно-чёрный сигнальный огонь – 65 Заточение тьмы
64)АНБУ захватывают Дандзо и неизвестного ниндзя Деревни Скрытого Дождя, для их допроса привлекают Ибики Морино, бывшего экзаменатора Наруто. Сора проникает в Зал допросов, где, используя свою особую силу когда-то разрушившую Храм Огня, нападает на Асуму, подтвердившего, что именно он убил Кадзуму. АНБУ использует против Соры сюрикены, однако на себя весь удар принимает Наруто. Соре удаётся бежать.
65)Во всей Конохе внезапно отключается электричество. Цунадэ вызывает всех капитанов Команд и объявляет в деревне 2-ой уровень тревоги. Асума, как и Наруто, начинает преследовать Сору. Четвёрка похитителей тел вызывает Пять Врат, благодаря которым деревня окружается силовым барьером, после чего Цунадэ объявляет 1-ый уровень тревоги.
Сора и Команда Ямато возвращаются в Коноху. Сай ложится в больницу. Сора затевает драку с тюнинами деревни. Фуридо, Фука, Фуэн и Фудо, Четвёрка похитителей тел, нападают на деревню клана Кохаку.
Сора и Команда Ямато попадают в ловушку похитителей тел, способных с помощью земляных техник менять ландшафт. Цунадэ приказывает АНБУ следить за Дандзо.
57)Ямато сообщает членам команды, что за последнее время вблизи Храма Огня были вскрыты 4 гробницы ниндзя. Наруто находит одну из скрытых гробниц, на него, по ошибке, нападает Сора, послушник Храма, который вместе с другими монахами должен был встретиться с командой Ямато.
58)Настоятель Храма рассказывает о том, что среди похищенных тел - тела членов Двенадцати Стражей Ниндзя, лучших синоби Страны Огня, защищавших феодала, среди которых когда-то был и Асума.
Наруто продолжает тренировки. Выясняется, что Асума - сын Третьего Хокагэ и дядя Конохамару. Какаси, также как и Дзирайя, получает задание собирать информацию об Акацуке. Команда Ямато отправляется на миссию.
Какаси выписывается из больницы, начинает тренировать Наруто и рассказывает ему о пяти стихиях, основе силы ниндзя, - Огонь, Ветер, Вода, Молния, Земля.
Наруто, Сакура и Сай навещают Какаси в больнице. Какаси предлагает Наруто создать свою собственную технику, по силе превосходящую даже Расэнган. Сай предпринимает попытки наладить отношения с друзьями Наруто.
Саске пытается нанести финальный удар, однако его останавливает Оротимару под предлогом, что синоби Конохи ещё могут им послужить - убить членов Акацуки. Команда Ямато возвращается в деревню и докладывает о произошедшем Цунадэ.
51)Рисованные змеи Сая нападают на Саскэ в его комнате, в ответ Утиха производит мощный взрыв. До места действий добираются Сакура, Наруто и Ямато.
52)Саскэ пытается убить Наруто, но вмешивается Сай. Саскэ использует Тидори всем телом, после чего ранит Ямато. Древесный клон исчезает, и Кабуто, которого он сторожил, освобождается. Саскэ, используя сяринган, проникает в душу Наруто и видит там Девятихвостого, силу которого подавляет.
Оротимару нападает на Наруто и Сая. Наруто настаивает на том, чтобы Сай продолжал поиски Саскэ. К Наруто присоединяются Ямато и Сакура. Оротимару отступает. Ямато обнаруживает книгу убийств Сая - книгу, в которой записаны имена тех, кого ниндзя должен убить; на одной из её страниц - Саскэ.
Команда связывает Сая и вытаскивает его на поверхность, но на них нападает Кабуто. Кабуто освобождает Сая, однако, неожиданно для всех, Сай нападает на Кабуто и связывает его. Снова проникшая в логово Саннина команда Ямато разделяется на две пары.
В логове Сай знакомится с Саскэ. Среди документов, переданных Оротимару от Дандзо, оказываются личные дела членов АНБУ. Ямато, Наруто и Сакура проникают в убежище.