Наруто снова принимает человеческий облик. Сай передаёт Оротимару послание Дандзо, после чего Оротимару говорит появившемуся Кабуто, что Сай теперь в их команде. Преследование Оротимару и Сая продолжает древесный клон Ямато. Сакура и Ямато делают предположение, что Сай, под руководством Дандзо, мог использовать миссию команды Ямато чтобы ближе подобраться к Орочимару.
Сакура вспоминает о том, как Наруто обещал во что бы то ни стало вернуть Саскэ и хочет остановить его, чтобы тот полностью не превратился в Лиса, однако Наруто-Лис ранит её. Кабуто неожиданно оказывает помощь Сакуре, после чего временно отступает, в то время как Ямато блокирует следующее нападение Наруто-Лиса и начинает наложение новой печати для подавления силы Лиса. К оставшемуся в лесу Оротимару подходит Сай и говорит, что у него есть послание от Дандзо, главы Корня АНБУ.
40 Кьюби на свободе – 41 Миссия высочайшей секретности
40)После едких слов Оротимару в Наруто снова пробуждается Девятихвостый. Количество хвостов покрова Лиса достигает трёх - максимальное количество, при котором Наруто ещё может контролировать его силу.
41)Разрушается мост. Сай на нарисованной им птице преследует углубившихся в лес Наруто и Оротимару. Число хвостов покрова Лиса достигает 4-х.
Ямато преображается в Сасори в виде его куклы Хируко; Наруто, Сакура и Сай ожидают в засаде. Шпионом Сасори оказывается Кабуто. Но, как выясняется, когда-то завербованный Акацуки он был перевербован и уже давно по собственной воле служит также появившемуся Оротимару.
36)По пути на миссию Наруто повторно высказывает претензии к Саю, которого он невзлюбил «с первого взгляда». Обстановка в команде заметно напряжена. Команда Ямато останавливается на горячих источниках.
37)Продолжая путь, команда останавливается для ночёвки в лесу и для этого Ямато вызывает... целый дом! Ямато просит Сакуру рассказать о Сасори.
Старейшины Конохи выступают против участия Наруто в крупных миссиях и даже хотят чтобы он никогда не покидал деревню; они, тем самым, пытаются оградить юношу от Акацуки. Цунадэ формирует новую команду: Наруто, Сакура, член АНБУ, Ямато, временно исполняющий обязанности Какаси, и ранее напавший на Наруто ниндзя, Сай, назначенный в команду Дандзо, руководителем запрещённой организации «КореньАНБУ».
Команды Гая и Какаси прибывают в Коноху. Ослабленный использованием мангэкё сярингана Какаси отправляется в больницу. Сакура сообщает Цунадэ о поведанном ей Сасори будущем расположении шпиона Оротимару. Наруто занят поиском новых членов команды из-за отсутствия Саскэ и выбывшего на некоторое время из строя Какаси, и впервые со времени своего возвращения встречает Шино, Кибу, сильно выросшего Акамару и Хинату. На Наруто нападает ниндзя, владеющий Техникой Рисованных Зверей.
Чиё использует технику Тэнсэй Ниндзюцу и ценой собственной жизни оживляет Гаару. На место событий прибывает команда Тэмари и другие ниндзя Деревни Песка.
29)Какаси использует мангэкью шаринган против Дэйдары, который в результате атаки лишается второй руки. Наруто уничтожает птицу, на которой летел Дэйдара, в её клюве находят тело Гаары.
30)В Наруто снова просыпается Девятихвостый, чакра юноши принимает форму Лиса, образуя т.н. «покров Лиса». Для предотвращения опасного развития событий, Какаси накладывает на Наруто печать, ранее переданную ему Дзирайей. К Наруто и Какаси поспевают Сакура и Тиё. Дэйдара сталкивается лицом к лицу с Командой Гая и взрывает себя; впоследствии оказывается, что это была лишь его копия-камикадзе.
Сильно раненая Сакура и отравленная попавшим в её организм ядом Тиё из последних сил, используя куклы родителей Сасори, уничтожают врага. Перед смертью Сасори сообщает Сакуре о том, где через 10 дней должна была состояться его встреча со шпионом, подосланным к Оротимару - на мосту Небес и Земли в Скрытой Деревне Травы.
Сакура думает, что уничтожила Сасори, однако его состоящее из множества частей кукольное тело восстанавливается. Для продолжения борьбы Тиё призывает 10 кукол, Сасори, в ответ, 100.
