40 Кьюби на свободе – 41 Миссия высочайшей секретности
40)После едких слов Оротимару в Наруто снова пробуждается Девятихвостый. Количество хвостов покрова Лиса достигает трёх - максимальное количество, при котором Наруто ещё может контролировать его силу.
41)Разрушается мост. Сай на нарисованной им птице преследует углубившихся в лес Наруто и Оротимару. Число хвостов покрова Лиса достигает 4-х.
Ямато преображается в Сасори в виде его куклы Хируко; Наруто, Сакура и Сай ожидают в засаде. Шпионом Сасори оказывается Кабуто. Но, как выясняется, когда-то завербованный Акацуки он был перевербован и уже давно по собственной воле служит также появившемуся Оротимару.
36)По пути на миссию Наруто повторно высказывает претензии к Саю, которого он невзлюбил «с первого взгляда». Обстановка в команде заметно напряжена. Команда Ямато останавливается на горячих источниках.
37)Продолжая путь, команда останавливается для ночёвки в лесу и для этого Ямато вызывает... целый дом! Ямато просит Сакуру рассказать о Сасори.
Старейшины Конохи выступают против участия Наруто в крупных миссиях и даже хотят чтобы он никогда не покидал деревню; они, тем самым, пытаются оградить юношу от Акацуки. Цунадэ формирует новую команду: Наруто, Сакура, член АНБУ, Ямато, временно исполняющий обязанности Какаси, и ранее напавший на Наруто ниндзя, Сай, назначенный в команду Дандзо, руководителем запрещённой организации «КореньАНБУ».
Команды Гая и Какаси прибывают в Коноху. Ослабленный использованием мангэкё сярингана Какаси отправляется в больницу. Сакура сообщает Цунадэ о поведанном ей Сасори будущем расположении шпиона Оротимару. Наруто занят поиском новых членов команды из-за отсутствия Саскэ и выбывшего на некоторое время из строя Какаси, и впервые со времени своего возвращения встречает Шино, Кибу, сильно выросшего Акамару и Хинату. На Наруто нападает ниндзя, владеющий Техникой Рисованных Зверей.
Чиё использует технику Тэнсэй Ниндзюцу и ценой собственной жизни оживляет Гаару. На место событий прибывает команда Тэмари и другие ниндзя Деревни Песка.